project file source in instructions

Instructions.md

@@ -76,27 +76,6 @@ connect the JAVA debugger to port 5005
 │           └── application.yaml
 | 
 # project sources
-├── src
-│   ├── main
-│   │   ├── java
-│   │   │   └── org
-│   │   │       └── gcube
-│   │   │           └── service
-│   │   │               └── helloworld
-#   │   #                   # Applicatoin manager
-│   │   │                   ├── HelloWorldManager.java
-#   │   #                   # Smartgear 4 Health Checks
-│   │   │                   ├── health
-│   │   │                   ├── mappers
-│   │   │                   │   ├── ForbiddenExceptionMapper.java
-│   │   │                   │   └── IDMExceptionMapper.java
-#   │   #                   # rest APIs served by jaxb. 
-│   │   │                   └── rest
-│   │   │                       ├── AuthenticatedService.java
-│   │   │                       ├── ExcludeAuthorizationService.java
-│   │   │                       └── *.java
-
-
 ├── src
 │   ├── main
 │   │   ├── java
@@ -104,62 +83,79 @@ connect the JAVA debugger to port 5005
 │   │   │       └── gcube
 │   │   │           └── service
 │   │   │               └── helloworld
-#   │   #                   # Applicatoin manager
 │   │   │                   ├── HelloWorldManager.java
 │   │   │                   ├── annotation
 │   │   │                   │   └── PURGE.java
 │   │   │                   ├── beans
 │   │   │                   │   └── ResponseBean.java
-#   │   #                   # Smartgear 4 Health Checks
 │   │   │                   ├── health
-│   │   │                   │   └── CreateTempFileCheck.java
-#   │   #                   # rest APIs served by jaxb. 
+│   │   │                   │   ├── CreateTempFileCheck.java
+│   │   │                   │   └── EmptyCheck.java
 │   │   │                   ├── rest
 │   │   │                   │   ├── AuthenticatedService.java
 │   │   │                   │   ├── ExcludeAuthorizationService.java
 │   │   │                   │   ├── HelloService.java
-#   │   #                   # Exception MApper
 │   │   │                   │   └── ServiceExceptionMapper.java
 │   │   │                   ├── serializers
-│   │   │                   │   ├── ContainerConfigurationSerializer.java
-│   │   │                   │   ├── ContainerContextSerializer.java
-│   │   │                   │   ├── ContextSerializator.java
-│   │   │                   │   ├── OwnerSerializer.java
-│   │   │                   │   └── SimpleCredentialsSerializer.java
 │   │   │                   └── utils
 │   │   │                       └── RestUtils.java
 │   │   ├── resources
 │   │   │   └── META-INF
 │   │   │       └── enunciate
 │   │   │           └── d4science_docs.fmt
-│   │   └── webapp
-#   #       # WEB-INF resources are accessible to the resource loader of your Web-Application 
-#   #       # and not served directly to a client by the container
-│   │       ├── WEB-INF
-#   #           # deployment descriptor
-│   │       │   └── web.xml
+│   │   ├── webapp
+#   #   #   # WEB-INF resources are accessible to the resource loader of your Web-Application 
+#   #   #   # and not served directly to a client by the container
+│   │   │   ├── WEB-INF
+#   #   #   #   # deployment descriptor
+│   │   │   │   └── web.xml
+│   │   │   └── api-docs
+│   │   │       └── css
+│   │   │           └── d4science_enunciate_custom.css
+│   │   └── webapp copy
 │   │       └── api-docs
 │   │           └── css
 │   │               └── d4science_enunciate_custom.css
 │   └── test
 │       ├── java
 │       └── resources
-
-
-# optional, vscode debug configuration 
-├── .vscode
-│   ├── launch.json
-│   ├── container.dev.ini
-│ 
+│
 # optional, for local develop in docker containers
-├── docker
-│   ├── .gitignore
-│   ├── container.dev.ini
-│   ├── container.ini -> container.dev.ini
-│   ├── devsec.gcubekey
-│   └── logback.xml
-├── build_conf
-├── buildImageAndStart.sh
+├── dockerize
+│   ├── buildImageAndStart.sh
+│   ├── build_conf
+│   ├── configuration
+│   │   ├── .gitignore
+│   │   ├── container.default.ini
+│   │   ├── container.ini -> container.xxx.ini
+│   │   ├── devsec.gcubekey
+│   │   └── logback.xml
+│   ├── docker.conf
+│   ├── loginHarborHub.sh
+│   ├── pull_docker.sh
+│   ├── push_docker.sh
+│   ├── start_docker.sh
+│   └── stop_docker.sh
+│
+# documentation config
+├── documentation
+#   # postman collections to test the API
+│   ├── postman
+│   │   ├── Hello World Env for devVRE.postman_environment.json
+│   │   └── Hello World Service.postman_collection.json
+│   │
+#   # enunciate configuration
+│   ├── enunciate.xml
+│   │
+#   # sphinx configuration
+│   └── sphinx
+│       ├── Makefile
+│       ├── conf.py
+│       ├── index.rst
+│       ├── make.bat
+│       └── tests.rst
+│
+# Docker file
 ├── Dockerfile
 │
 # optional, sphinx configuration
@@ -170,6 +166,11 @@ connect the JAVA debugger to port 5005
 │   ├── make.bat
 │   └── tests.rst
 │
+# optional, vscode debug configuration 
+├── .vscode
+│   ├── launch.json
+│   └── container.dev.ini
+│
 # optional, enunciate configuration
 ├── enunciate.xml
 │